基于表觀遺傳學的精準醫療在原發灶不明轉移癌中的應用

發布時間:2017-08-27 12:44     文章來源:medical research     作者:shelly

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原發灶不明轉移癌(cancer of unknown primary,CUP)是世界范圍內發生頻率最高的十大癌癥之一,并且是造成癌癥患者死亡的第四大常見原因。目前國際上對CUP沒有統一的定義,普遍認為:組織學上明確為轉移癌,經過全面的病史詢問,完整的體格檢查,包括血檢,尿檢、組織病理學檢測、X射線、CT等仍未找到原發部位的癌癥。在目前發現的實體瘤中,CUP約占總數的3%~5%,但是目前國際上對于CUP的治療眾說紛紜,尚無統一和有效的治療方案,這直接導致CUP預后較差,中位生存期僅6-9個月,因此對于CUP患者,及時明確原發灶,從而合理地選擇治療方案對提高療效、改善預后、延長生命周期是十分重要的。
對于CUP的診斷而言,傳統的方法(包括免疫組化、核磁共振等)只能夠鑒別30% CUP的原發灶位置。近些年,隨著精準醫療的發展,一些分子生物學方法逐漸被應用到疾病診斷中?;諢蟣澩鐫げ獾木家攪品椒ū揮τ糜贑UP的診斷中,能夠明顯將診斷準確率提升至70%~90%,如下圖一所示,但是這一方法仍存在價格昂貴,RNA樣本也在手術操作時被破壞等缺點。
新的精準醫療檢測方案的提出,對CUP的診斷治療至關重要。已有研究發現,DNA甲基化能夠在不改變DNA序列的基礎上調節基因的表達,影響DNA和蛋白相互作用,調節細胞分化等。更重要的是,DNA甲基化可以抑制抑癌基因的表達(如CDKN2A, CDKN2B, MLH1, MGMT, CDH1等),從而促進癌癥的發生發展。但是由于數據量的不足,DNA甲基化模式研究局限于部分疾病的少量特定基因組位點。而在2012年,科學家們通過高通量測序的方法,首次研究了1000多例患者樣本的1505個CpG位點,繪制了DNA甲基化圖譜,鑒定出24種不同腫瘤類型的特定指紋。在此基礎上,2016年的Lancet Oncol上報道提出了一種基于表觀遺傳學的CUP診斷方法——EPICUP,通過檢測CUP組織的DNA甲基化情況,與甲基化指紋圖譜對比預測原發腫瘤灶位置,這一方法的預測成功率達到了87%~100%(如圖一)。
綜上所述,精準醫療分子診斷方法的發展,對于癌癥患者的診斷治療、預后提升是極其重要的,而其中,DNA甲基化分子檢測平臺(如EPICUP)將成為癌癥臨床診斷中不可或缺的關鍵性技術之一。

 

圖一 各檢測方法的檢測效果